Το Σωματείο διοικείται από το επταμελές (7) Συμβούλιο Διοίκησης το οποίο απαρτίζεται από τον Πρόεδρο, το τριμελές Ιδρυτικό Συμβούλιο και την τριμελή Εκτελεστική Γραμματεία. Αναλυτικότερα, το Ιδρυτικό Συμβούλιο απαρτίζεται από τον Αντιπρόεδρο και δύο μέλη και η Εκτελεστική Γραμματεία από τον Αναπληρωτή Πρόεδρο, τον Γενικό Γραμματέα και ένα μέλος. Ειδικότερα, ο Πρόεδρος πρέπει να είναι αυστηρά κάτοχος βασικού πτυχίου Πολιτικών Επιστημών – Διεθνών Σχέσεων ή κάτοχος διδακτορικού διπλώματος Πολιτικής Επιστήμης και να είναι ιδρυτικό μέλος ή να έχει λάβει τα δικαιώματα ιδρυτικού μέλους.

Ο Πρόεδρος του Συμβουλίου Διοίκησης, δηλαδή ο Πρόεδρος του Ε.Ο.Π.Ε. αποτελεί το ανώτατο εκτελεστικό όργανο και έχει την δυνατότητα έκδοσης αποφάσεων στα πλαίσια του παρόντος καταστατικού.

Το Ιδρυτικό Συμβούλιο απαρτίζεται από ιδρυτικά μέλη ενώ η Εκτελεστική Γραμματεία από τακτικά μέλη. Τα τρία μέρη του Συμβουλίου Διοίκησης συνδιοικούν ισότιμα ως σύνολο το Σωματείο. Ειδικότερα, τακτικό μέλος το οποίο έχει λάβει τα δικαιώματα ιδρυτικού μέλους, δύναται να θέσει υποψηφιότητα στο Ιδρυτικό Συμβούλιο ύστερα από σχετική αίτησή του, η οποία εγκρίνεται από το Συμβούλιο Διοίκησης.

Ο ΠΡΟΕΔΡΟΣ του Ε.Ο.Π.Ε.